瓊脂糖核酸電泳操作步驟詳解
1. ?實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備?
儀器檢查?:確認(rèn)電泳儀電源、電壓調(diào)節(jié)旋鈕及電極連接正常,凝膠成像系統(tǒng)光源和軟件功能完好?。
試劑配制?:
根據(jù)DNA片段大小選擇瓊脂糖濃度(0.5%-2%),如大片段(>1kb)用0.5%-1%,小片段(<1kb)用1.5%-2%?。
緩沖液常用TAE或TBE,需檢查pH值(TAE為8.0,TBE為8.3)及是否變質(zhì)?。
安全防護(hù)?:佩戴手套,避免接觸溴化乙錠(EB)等致癌染料,推薦使用安全替代品(如GelRed)?。
2. ?凝膠制備?
溶解瓊脂糖?:
稱取瓊脂糖干粉,按比例加入緩沖液(如1%凝膠:0.3g瓊脂糖+30mL TAE)?。
微波爐高火加熱1-2分鐘至溶解,避免沸騰溢出?。
加染料與倒膠?:
冷卻至50-60℃后加入核酸染料(如EB替代物),混勻?。
緩慢倒入制膠模具,避免氣泡,厚度3-5mm,靜置30-45分鐘凝固?。
3. ?電泳操作?
安裝凝膠?:
凝固后輕拔梳子,將凝膠放入電泳槽,加入緩沖液至液面略高于膠面1mm?。
上樣?:
樣品與6×Loading Buffer按10:1混合,緩慢加入加樣孔,避免穿破凝膠?。
電泳參數(shù)?:
電壓60-100V,DNA由負(fù)極(黑色)向正極(紅色)遷移?。
大片段DNA(>2kb)建議5-8V/cm電壓,避免高電壓導(dǎo)致條帶模糊?。
4. ?結(jié)果觀察與分析?
終止電泳?:當(dāng)溴酚藍(lán)遷移至凝膠2/3處時停止?。
成像檢測?:紫外燈或凝膠成像儀觀察條帶,與Marker對比判斷DNA大小?。
常見問題與優(yōu)化
條帶異常?:可能因DNA構(gòu)象(超螺旋/線性)或瓊脂糖質(zhì)量差異導(dǎo)致遷移率不同?。
電壓影響?:高電壓加速小片段遷移,但對大片段效果有限?。
注:以上僅供參考,科研使用,不作為實(shí)際數(shù)據(jù),實(shí)驗(yàn)需嚴(yán)格遵循說明或咨詢技術(shù)老師。
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